[开源推广]RNAFlow :使用MCP 优化的rna-seq分析流程,做生物信息的佬可以看一下呀
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问题描述:
github.com
本帖使用社区开源推广,符合推广要求。我申明并遵循社区要求的以下内容:
- 我的帖子已经打上 开源推广 标签: 是
- 我的开源项目完整开源,无未开源部分: 是
- 我的开源项目已链接认可 LINUX DO 社区: 是
- 我帖子内的项目介绍,AI生成、润色内容部分已截图发出: 是
- 以上选择我承诺是永久有效的,接受社区和佬友监督: 是
以下为项目介绍正文内容,AI生成、润色内容已使用截图方式发出
佬友们,晚上好!最近在做 bulk RNA-seq 批量分析,顺手把脚本重构了——Snakemake 工作流 + MCP/AI 集成 ,现在 AI 可以直接调服务器跑转录组了。算是对之前工作的总结开源,感兴趣的朋友可以看看代码提提意见!
GitHub - xsx123123/RNAFlow: RNAFlow
RNAFlow
GitHub - xsx123123/RNAFlow: RNAFlow
RNAFlow
Introduce
RNAFlow 是一个基于 Snakemake 的高扩展性、模块化 RNA-seq
数据分析流水线。它专门为处理大规模转录组测序数据而设计,能够自动完成从原始测序数据(FastQ)到差异表达分析、功能富集、甚至是 AI 辅助结果解读的全过程。
Feature
- 流程编排:Snakemake(支持集群调度如 SLURM/SGE,保证任务依赖和断点续传)。
问题描述:
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本帖使用社区开源推广,符合推广要求。我申明并遵循社区要求的以下内容:
- 我的帖子已经打上 开源推广 标签: 是
- 我的开源项目完整开源,无未开源部分: 是
- 我的开源项目已链接认可 LINUX DO 社区: 是
- 我帖子内的项目介绍,AI生成、润色内容部分已截图发出: 是
- 以上选择我承诺是永久有效的,接受社区和佬友监督: 是
以下为项目介绍正文内容,AI生成、润色内容已使用截图方式发出
佬友们,晚上好!最近在做 bulk RNA-seq 批量分析,顺手把脚本重构了——Snakemake 工作流 + MCP/AI 集成 ,现在 AI 可以直接调服务器跑转录组了。算是对之前工作的总结开源,感兴趣的朋友可以看看代码提提意见!
GitHub - xsx123123/RNAFlow: RNAFlow
RNAFlow
GitHub - xsx123123/RNAFlow: RNAFlow
RNAFlow
Introduce
RNAFlow 是一个基于 Snakemake 的高扩展性、模块化 RNA-seq
数据分析流水线。它专门为处理大规模转录组测序数据而设计,能够自动完成从原始测序数据(FastQ)到差异表达分析、功能富集、甚至是 AI 辅助结果解读的全过程。
Feature
- 流程编排:Snakemake(支持集群调度如 SLURM/SGE,保证任务依赖和断点续传)。

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