如何使用eggNOG 5.0数据库进行基因功能注释?

2026-06-10 23:511阅读0评论SEO资源
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本文共计1428个文字,预计阅读时间需要6分钟。

如何使用eggNOG 5.0数据库进行基因功能注释?

目录

1.eggNOG简介

2.eggNOG-Mapper注释原理

3.eggNOG 5.0数据资源

4.eggNOG-Mapper使用方法

5.NOG、KOG、COG、KEGG、GO区分类别

1.eggNOG简介

最新研究应用的一套系统

目录

  • ​​1. eggNOG简介​​
  • ​​2. eggNOG-Mapper注释原理​​
  • ​​3. eggNOG 5.0数据资源​​
  • ​​4. eggNOG-Mapper使用​​
  • ​​5. NOG、KOG、COG、KEGG、GO区别?​​

1. eggNOG简介

最近考虑到所用的一些数据库太旧了,需要更新。在整理的时候发现eggNOG数据库在去年的时候已经做了一次更新​​eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated orthology resource based on 5090 organisms and 2502 viruses​​​。距离上个版本​​eggNOG4.5​​​已经过去了3-4年,更新频率相对来说比较慢。但这次更新的内容是翻倍式增加的,以下是4.5和5.0比较。

eggNOG数据库全称是:直系同源蛋白分组比对(evolutionary genealogy of genes: Non-supervised Orthologous Groups)数据库,由EMBL创建维护,是对NCBI的COG数据库进行拓展,提供不同分类水平蛋白的直系同源分组(Orthologous Groups,OG),包括真核、原核及病毒的数据信息。

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如何使用eggNOG 5.0数据库进行基因功能注释?

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1.eggNOG简介

2.eggNOG-Mapper注释原理

3.eggNOG 5.0数据资源

4.eggNOG-Mapper使用方法

5.NOG、KOG、COG、KEGG、GO区分类别

1.eggNOG简介

最新研究应用的一套系统

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  • ​​1. eggNOG简介​​
  • ​​2. eggNOG-Mapper注释原理​​
  • ​​3. eggNOG 5.0数据资源​​
  • ​​4. eggNOG-Mapper使用​​
  • ​​5. NOG、KOG、COG、KEGG、GO区别?​​

1. eggNOG简介

最近考虑到所用的一些数据库太旧了,需要更新。在整理的时候发现eggNOG数据库在去年的时候已经做了一次更新​​eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated orthology resource based on 5090 organisms and 2502 viruses​​​。距离上个版本​​eggNOG4.5​​​已经过去了3-4年,更新频率相对来说比较慢。但这次更新的内容是翻倍式增加的,以下是4.5和5.0比较。

eggNOG数据库全称是:直系同源蛋白分组比对(evolutionary genealogy of genes: Non-supervised Orthologous Groups)数据库,由EMBL创建维护,是对NCBI的COG数据库进行拓展,提供不同分类水平蛋白的直系同源分组(Orthologous Groups,OG),包括真核、原核及病毒的数据信息。

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