如何使用eggNOG 5.0数据库进行基因功能注释?
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本文共计1428个文字,预计阅读时间需要6分钟。
目录
1.eggNOG简介
2.eggNOG-Mapper注释原理
3.eggNOG 5.0数据资源
4.eggNOG-Mapper使用方法
5.NOG、KOG、COG、KEGG、GO区分类别
1.eggNOG简介
最新研究应用的一套系统目录
- 1. eggNOG简介
- 2. eggNOG-Mapper注释原理
- 3. eggNOG 5.0数据资源
- 4. eggNOG-Mapper使用
- 5. NOG、KOG、COG、KEGG、GO区别?
1. eggNOG简介
最近考虑到所用的一些数据库太旧了,需要更新。在整理的时候发现eggNOG数据库在去年的时候已经做了一次更新eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated orthology resource based on 5090 organisms and 2502 viruses。距离上个版本eggNOG4.5已经过去了3-4年,更新频率相对来说比较慢。但这次更新的内容是翻倍式增加的,以下是4.5和5.0比较。
eggNOG数据库全称是:直系同源蛋白分组比对(evolutionary genealogy of genes: Non-supervised Orthologous Groups)数据库,由EMBL创建维护,是对NCBI的COG数据库进行拓展,提供不同分类水平蛋白的直系同源分组(Orthologous Groups,OG),包括真核、原核及病毒的数据信息。
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1.eggNOG简介
2.eggNOG-Mapper注释原理
3.eggNOG 5.0数据资源
4.eggNOG-Mapper使用方法
5.NOG、KOG、COG、KEGG、GO区分类别
1.eggNOG简介
最新研究应用的一套系统目录
- 1. eggNOG简介
- 2. eggNOG-Mapper注释原理
- 3. eggNOG 5.0数据资源
- 4. eggNOG-Mapper使用
- 5. NOG、KOG、COG、KEGG、GO区别?
1. eggNOG简介
最近考虑到所用的一些数据库太旧了,需要更新。在整理的时候发现eggNOG数据库在去年的时候已经做了一次更新eggNOG 5.0: a hierarchical, functionally and phylogenetically annotated orthology resource based on 5090 organisms and 2502 viruses。距离上个版本eggNOG4.5已经过去了3-4年,更新频率相对来说比较慢。但这次更新的内容是翻倍式增加的,以下是4.5和5.0比较。
eggNOG数据库全称是:直系同源蛋白分组比对(evolutionary genealogy of genes: Non-supervised Orthologous Groups)数据库,由EMBL创建维护,是对NCBI的COG数据库进行拓展,提供不同分类水平蛋白的直系同源分组(Orthologous Groups,OG),包括真核、原核及病毒的数据信息。

