阿里云架构师马颂：云上高性能计算如何助力基因测序改写未来？

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基于HPC的大内存实例解决方案：计算快、成本低、运维简、助生态+摘要：本文整理自阿里云行业解决方案架构师马彦（栋宇），在阿里云计算情报局的分享。主要内容分为三部分：

基于E-HPC的大内存实例解决方案：算得快、成本低、简运维、助生态

摘要：本文整理自阿里云行业解决方案架构师马颂（栖逸），在阿里云计算情报局的分享。本篇内容主要分为三个部分：

1. 寻因生物简介

2. 单细胞测序及其痛点

3. 寻因生物基于 E-HPC 的大内存实例解决方案

01 寻因生物简介

寻因生物创始团队及公司于 2018 年正式启动组建运营，是一家专注于单细胞技术的生物科技企业。致力于通过自主研发的高通量单细胞产品实验及生信分析全链条服务，将单细胞技术普适化，助力临床诊断和药物研发，推动精准医疗进入 2.0 时代。

这家成立于 2018 年，驻扎在北大医疗产业园的初创企业，在 2022 年 1 月获得 D 轮融资，并在上海、广州和成都设立地方实验室。公司面向临床及科研工作者的实际需求，搭建了从样本保存、解离到生信分析的全链条单细胞测序产品及服务解决方案。客户将样本送到寻因生物上海、广州或成都的实验室。

样品采集到之后，在实验室中通过实验进行序列加工和信号放大，将分子循环扩增，给每一个分子和细胞加上标签。辅助识别检测的分子来自哪个细胞、哪个基因。而后通过物流的方式送到北京进行测序。测序的结果上传到寻因的阿里云 OSS 或通过专线下载到本地，再做单细胞分析。