如何非root用户在Linux系统上安装并分析Lefse软件？

本文共计1395个文字，预计阅读时间需要6分钟。

Lefse软件是宏组学研究常用的软件，通常大家用在线版本即可。但若要在Linux集群环境中搭建，过程会有些繁琐，以下是一些安装步骤记录。

安装：

1.确保系统中已安装Python2。

2.下载Lefse软件源码。

3.解压源码包。

4.进入源码目录，运行安装脚本。

5.根据提示完成安装。

说明

​​Lefse​​​软件是宏组学物种研究常用软件，一般大家用在线版本即可。但要搭建在​​Linux​​集群环境中有点烦，记录一下折腾过程。

安装

这个软件是​​python2​​​写的，因此假设我已经安装好了较高版本的​​python2​​​以及​​pip​​​等工具，在此基础上来安装​​lefse​​​。
​​​lefse​​​下载地址：​​bitbucket.org/nsegata/lefse/src/default/​​​。这个网站有丰富的学习内容和教程，包括​​MetaPhIAn​​等流程，有时间去好好看看。