分子动力学模拟中，有哪些算法框架被广泛应用？
本文共计3883个文字，预计阅读时间需要16分钟。分子动力学模拟是跨越众多科学领域的强大工具，从物理学的角度研究分子动力学模拟，它基于量子力学（量子化学生）构建模型，通过牛頓力学进行模拟，最终能模拟时间的演变。分子动力学模拟是一个跨越众多学
分子动力学模拟中SETTLE约束算法是如何实现的？
本文共计6456个文字，预计阅读时间需要26分钟。继上一篇文章介绍了分子动力学模拟中常用的LINCS约束算法之后，本文将介绍一种SETTLE约束算法，并探讨其基于Jax的实现方案。SETTLE约束算法是一种针对分子动力学模拟中原子间距离约束